關于《食品衛生許可證》的概念目前很多人存在理解誤區，《食品衛生許可證》已經失效，目前被食品生產許可證、食品流通許可證、餐飲服務許可證所代替。

食品生產許可證：食品生產加工的企業需要辦理；

食品流通許可證：食品銷售的企業需要辦理此證件，經營范圍是預包裝食品（冷凍冷藏，熟食鹵味，乳制品），括號中的幾項對辦公場地和倉庫有特殊要求，需要單列出來；另外食用農產品不需要辦理此證件，比如蔬菜，瓜果等，但是生豬，牛，羊肉的銷售不僅需要辦理食品流通許可證，還需要辦理黃卡綠卡。

餐飲服務許可證：做餐飲的企業需要辦理此證件，包括：果汁飲品，奶茶店，小型飯店，大型飯店等。

《食品衛生許可證》是《食品衛生許可證管理辦法》的產物。
根據2005年12月衛生部印發的《食品衛生許可證管理辦法》，“任何單位和個人從事食品生產經營活動，應當向衛生行政部門申報，并按照規定辦理衛生許可證申請手續；經衛生行政部門審查批準后方可從事食品生產經營活動，并承擔食品生產經營的食品衛生責任。”
“地方人民政府衛生行政部門遵守本辦法，對食品生產經營者發放衛生許可證。”
“食品添加劑、保健食品和新資源食品生產企業生產活動的衛生許可，由省級衛生行政部門發放衛生許可證。”